Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NCF4Q15080 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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NCF4Q15080 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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NCF4Q15080 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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NCF4Q15080 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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NCF4Q15080 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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NCF4Q15080 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NCF4Q15080 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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