Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KARSQ15046 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KARSQ15046 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
KARSQ15046 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KARSQ15046 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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