Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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GPNMBQ14956 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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GPNMBQ14956 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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GPNMBQ14956 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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GPNMBQ14956 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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GPNMBQ14956 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPNMBQ14956 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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