Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCARB2Q14108 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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SCARB2Q14108 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCARB2Q14108 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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