Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CAPSQ13938 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CAPSQ13938 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CAPSQ13938 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CAPSQ13938 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CAPSQ13938 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CAPSQ13938 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CAPSQ13938 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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