Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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