Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
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