Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATP1A4Q13733 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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