Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CUL4AQ13619 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CUL4AQ13619 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CUL4AQ13619 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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