Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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TCOF1Q13428 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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TCOF1Q13428 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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TCOF1Q13428 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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TCOF1Q13428 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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TCOF1Q13428 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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TCOF1Q13428 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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TCOF1Q13428 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TCOF1Q13428 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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