Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MSLNQ13421 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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