Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MRPL49Q13405 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MRPL49Q13405 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MRPL49Q13405 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MRPL49Q13405 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MRPL49Q13405 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
MRPL49Q13405 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
MRPL49Q13405 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MRPL49Q13405 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MRPL49Q13405 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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