Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NME3Q13232 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NME3Q13232 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NME3Q13232 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NME3Q13232 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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