Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPA4Q13156 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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