Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHAF1BQ13112 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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