Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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