Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
CPSF1Q10570 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CPSF1Q10570 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.8 ms