Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

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Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SEC24CP53992 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEC24CP53992 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC24CP53992 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEC24CP53992 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC24CP53992 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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