Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TSPOP30536 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TSPOP30536 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TSPOP30536 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TSPOP30536 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms