Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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HOXD10P28358 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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HOXD10P28358 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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HOXD10P28358 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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HOXD10P28358 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXD10P28358 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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