Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CTIFO43310 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTIFO43310 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTIFO43310 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTIFO43310 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CTIFO43310 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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