Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CGGBP1Q9UFW8 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CGGBP1Q9UFW8 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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