Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
EHD3Q9NZN3 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms