Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TMOD3Q9NYL9 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TMOD3Q9NYL9 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms