Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ZBED3Q96IU2 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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