Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC47Q96A33 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.3 ms