Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHCHD4Q8N4Q1 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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