Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP30Q70CQ3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms