Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED9Q6R2W3 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZBED9Q6R2W3 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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