Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C9orf135Q5VTT2 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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