Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TDRD12Q587J7 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TDRD12Q587J7 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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