Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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