Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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CCDC142Q17RM4 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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CCDC142Q17RM4 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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CCDC142Q17RM4 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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CCDC142Q17RM4 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CCDC142Q17RM4 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CCDC142Q17RM4 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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