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| UPP1 | Q16831 | RAB28P5-201 | ENST00000427490 | 651 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | TOMM22P2-201 | ENST00000430735 | 237 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL160004.2-201 | ENST00000432935 | 350 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC092813.2-201 | ENST00000434540 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC099677.2-201 | ENST00000436385 | 175 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND4P19-201 | ENST00000446659 | 478 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.631-201 | ENST00000459607 | 101 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
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| UPP1 | Q16831 | RNU6-408P-201 | ENST00000515910 | 100 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
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| UPP1 | Q16831 | SKIL-204 | ENST00000458537 | 7182 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.4-201 | ENST00000362333 | 112 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC027419.1-201 | ENST00000522976 | 328 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AL138825.1-201 | ENST00000618587 | 192 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC091812.1-201 | ENST00000432235 | 1948 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| UPP1 | Q16831 | CENPQ-201 | ENST00000335783 | 1733 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | ATP11C-202 | ENST00000361648 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU1-96P-201 | ENST00000364163 | 162 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.216-201 | ENST00000364205 | 93 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-417P-201 | ENST00000384712 | 107 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA48.1-201 | ENST00000390879 | 135 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL117342.1-201 | ENST00000404861 | 406 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
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| UPP1 | Q16831 | RNU6-321P-201 | ENST00000410912 | 106 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC008134.1-201 | ENST00000420943 | 193 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC003988.1-201 | ENST00000447198 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP57-201 | ENST00000459463 | 123 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL26P26-201 | ENST00000480251 | 434 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1012P-201 | ENST00000516606 | 109 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.701-201 | ENST00000516812 | 110 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RRM2B-207 | ENST00000519962 | 201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP003128.1-201 | ENST00000531414 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | NKAIN2-205 | ENST00000546092 | 148 nt | TSL 5 BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL161670.1-201 | ENST00000554348 | 137 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC022254.1-201 | ENST00000567857 | 235 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR4659A-201 | ENST00000580269 | 81 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | CENPF-206 | ENST00000614578 | 528 nt | TSL 5 BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC134503.1-201 | ENST00000633048 | 54 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR338-201 | ENST00000636369 | 67 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | MUC15-203 | ENST00000455601 | 3156 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | ZNF209P-201 | ENST00000593450 | 2304 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.11-201 | ENST00000362375 | 109 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1266P-201 | ENST00000362794 | 105 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.128-201 | ENST00000363391 | 112 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.238-201 | ENST00000364441 | 102 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.287-201 | ENST00000364853 | 94 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-1240P-201 | ENST00000365155 | 104 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC108488.2-201 | ENST00000438485 | 421 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC112492.4-201 | ENST00000456549 | 352 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL163540.1-201 | ENST00000485382 | 386 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA40.14-201 | ENST00000516543 | 86 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC087518.1-201 | ENST00000524098 | 187 nt | TSL 3 BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC023442.1-201 | ENST00000531247 | 422 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNHG14-219 | ENST00000553134 | 470 nt | TSL 2 BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC055872.1-201 | ENST00000570978 | 278 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR3171-201 | ENST00000584270 | 74 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL359821.1-201 | ENST00000605519 | 182 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL353149.1-201 | ENST00000610667 | 244 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Hammerhead_HH9.1-201 | ENST00000616606 | 77 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC022140.2-201 | ENST00000623500 | 188 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR3674-201 | ENST00000636576 | 68 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC005592.1-201 | ENST00000566527 | 1640 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | CYLC2-202 | ENST00000487798 | 2053 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.28-201 | ENST00000362554 | 111 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-454P-201 | ENST00000364292 | 107 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA22B-201 | ENST00000383876 | 138 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC006159.2-201 | ENST00000421965 | 692 nt | TSL 2 BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | SDAD1P3-201 | ENST00000427380 | 333 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC02238-202 | ENST00000436262 | 320 nt | TSL 3 BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | HSPE1P21-201 | ENST00000438283 | 308 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009474.2-201 | ENST00000451383 | 136 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | TRAPPC2P7-201 | ENST00000509650 | 231 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.711-201 | ENST00000516993 | 102 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC040926.1-201 | ENST00000530195 | 238 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC020661.2-201 | ENST00000560114 | 134 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR4421-201 | ENST00000578133 | 69 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | DLEU2_2.2-201 | ENST00000615474 | 90 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC240442.1-201 | ENST00000616055 | 283 nt | BASIC | 1.56 | □□□□□ -2.16 | | |