Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
LAMA3Q16787 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
LAMA3Q16787 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms