Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
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PTPRKQ15262 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRKQ15262 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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