Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TRAM2Q15035 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TRAM2Q15035 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms