Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERPUD1Q15011 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERPUD1Q15011 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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