Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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RAB39AQ14964 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RAB39AQ14964 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
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