Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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