Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CAPRIN1Q14444 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms