Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SCARF1Q14162 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SCARF1Q14162 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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