Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C1DQ13901 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
C1DQ13901 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
C1DQ13901 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
C1DQ13901 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
C1DQ13901 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
C1DQ13901 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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