Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CUL4BQ13620 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CUL4BQ13620 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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