Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
TCOF1Q13428 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms