Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP140Q13342 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SP140Q13342 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SP140Q13342 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SP140Q13342 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SP140Q13342 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SP140Q13342 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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