Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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