Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1BQ13112 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHAF1BQ13112 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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