Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GPS1Q13098 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GPS1Q13098 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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