Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK2Q13002 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK2Q13002 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms